Ce projet nécessite d'avoir assimilé l'ensemble des notions des quatre premiers modules du cours de science des données biologiques 2. Il correspond au dépôt GitHub https://github.com/BioDataScience-Course/B04Ia_who.
Ce projet est court, individuel et cadré. Il vise à compléter votre apprentissage en modélisation de données biologiques en vous initiant aux modèles linéaires. Dans ce projet, vous devez :
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Décrire correctement des données en vue de leur modélisation
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Créer et analyser des modèles linéaires combinant variables réponses qualitatives et quantitatives
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Simplifier un modèle linéaire et décider quel modèle retenir (AIC, ANOVA)
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Faire l'analyse des résidus de modèles linéaires
Complétez les zones manquantes dans le fichier who_notebook.qmd. Compilez la version finale au format HTML. Vous avez une batterie de tests à votre disposition (onglet "Construire" -> bouton "Construire tout") pour vérifier l'état travail. Note : utilisez ces tests à la fin. Concentrez-vous d'abord sur vos analyses, puis faites un rendu final du document lorsque tout est complété, et seulement après, utilisez les tests. Il est contre-productif d'activer les tests à chaque nouvelle ligne de code ajoutée dans votre document !
Les données employées proviennent de Kaggle (Life Expectancy (WHO) Fixed). Consultez cette page pour avoir plus d'informations sur les données et leur provenance. Ces données sont dans data/raw/Life-Expectancy-Data-Updated.csv. Elles sont distribuées sous licence CC0 domaine public. Une version modifiée de ce jeu de données est placé dans data/who.rds. Elle est créée à partir du script R/import_who.R qui est joint pour votre information (mais vous n'avez pas besoin de le réexécuter). Vous partirez du jeu de données data/who.rds pour réaliser votre analyse.
Un projet dont le document ne compile pas à partir de la version présente sur GitHub obtient la note de zéro pour ce travail. Un document qui compile sur votre ordinateur, mais pas depuis GitHub (fichier oublié dans le commit, push non effectué...), est considéré comme ne compilant pas.
Dans le cadre de votre travail, vous avez le droit d’être aidé par l’intelligence artificielle. Le chatbot SciViews est disponible dans votre RStudio sur Saturn Cloud via l’addin Help. Il répond aux questions concernant le langage R, les statistiques et la science des données.
Vous restez responsables de tout ce que contiennent vos documents : vérifiez le code et les interprétations proposés par l'IA, et assurez-vous que êtes capable de les expliquer.
L'utilisation de l'IA doit être déclarée dans les deux documents, dans la sous-section Déclaration sur l'utilisation de l'IA de la partie Matériel et méthodes :
Dans le carnet de notes who_notebook.qmd, cochez la case qui correspond à votre situation dans le chunk ai_comment (remplacez [] par [X]), puis précisez en dessous l'utilisation que vous avez faite de l'IA et citez le ou les modèles employés